Я запускаю код с помощью консоли tk в VMD (Visual Molecular Dynamics). Первая проблема, с которой я столкнулся, заключалась в том, что код потреблял слишком много вычислительной мощности моего компьютера и приводил к отключению VMD. Я думаю, это...

Я пытаюсь использовать команду atomselect для удаления липидов в области белков в моем файле .gro . Поскольку это крупнозернистый файл мартини, я могу просто использовать ключевые слова resname для названий остатков и name или type для типов...